2016–2017 Ziraat Türkiye Kupası 3. Eleme Turu kuraları TFF’nin Beykoz-Riva'daki idari merkezinde bulunan Orhan Saka Salonu'nda çekildi. Ziraat Türkiye Kupası'nda 3. Tur’da mücadele eden temsilcimiz 24 Erzincanspor’un 3.Turda karşılaşacağı rakibi 1.lig Lig takımlarından Yeni Malatyaspor oldu. 
Ziraat Türkiye Kupası’nda 1. Tur’da Muşspor’u  2. Tur’da ise Süper lig ekiplerinden Adanaspor’u  eleyen temsilcimiz 24 Erzincanspor’un 3.Turda ise Yeni Malatyaspor’la eşleşti. Türkiye Futbol Federasyonu'ndan (TFF) yapılan açıklamaya göre, 25,26,27 Ekim  tarihlerinde oynanacak 2016–2017 Ziraat Türkiye Kupası 3.Tur karşılaşmaları Tek maç eleme usulüne göre oynanacak müsabakalarda rakiplerini yenen 27 takım gruplara kalacak. Temsilcimiz 24 Erzincanspor 3. Turda karşılaşacağı Yeni Malatyaspor  maçını kendi sahasında oynayacak.